Akiva Schaffer fait ses débuts comme membre du trio comique The Lonely Island, formé avec ses amis d'enfance Andy Samberg et Jorma Taccone, avec lesquels il enchaîne les courts-métrages humoristiques avant de rejoindre l'équipe de Saturday Night Live au milieu des années 2000. Il y coréalise de nombreux Digital Shorts devenus viraux, qui contribuent à populariser un format de vidéo musicale absurde sur internet. Il passe au long métrage avec Hot Rod en 2007, une comédie centrée sur un cascadeur amateur, avant de réaliser The Watch en 2012 avec un casting de comédie plus large. En 2016, il coréalise avec Jorma Taccone Popstar : Jamais assez, satire du monde de la pop portée par Andy Samberg. Il se tourne ensuite vers l'animation en réalisant Chip et Dale : Duo de choc en 2022 pour Disney, un film qui mélange animation et prises de vues réelles. Il continue en parallèle de coécrire et produire de nombreux projets avec ses complices de The Lonely Island.
Schaffer revendique l'héritage des comédies absurdes des années 1980 et 1990, ainsi que l'influence directe des sketches musicaux et de la culture internet naissante des années 2000. Son travail au sein de The Lonely Island doit beaucoup au format du clip parodique, où l'humour naît du décalage entre une esthétique musicale sérieuse et des paroles délibérément ridicules. Il cite aussi l'influence de la comédie télévisée américaine, en particulier les sketches de SNL, sur son sens du timing comique.
Son cinéma repose sur un humour référentiel et volontiers absurde, souvent construit autour de personnages excentriques confrontés à des situations décalées. Il affectionne les ruptures de ton rapides, où une scène de comédie pure bascule soudainement vers la parodie de genre, notamment le film d'action ou le biopic musical. Sa direction reste marquée par son expérience de la vidéo musicale, avec un sens du montage rythmique hérité de ses années à The Lonely Island.
Akiva Schaffer n'a pas reçu de récompense cinématographique majeure, son travail relevant davantage de la comédie populaire que des cérémonies prestigieuses. Il a en revanche été plusieurs fois nommé aux Emmy Awards pour ses contributions en tant qu'auteur et réalisateur sur Saturday Night Live.
Andy Samberg et Jorma Taccone, ses partenaires au sein de The Lonely Island, restent ses collaborateurs les plus constants, que ce soit devant ou derrière la caméra. Il a également travaillé à plusieurs reprises avec des équipes techniques issues de Saturday Night Live, dont il a conservé les habitudes de production rapide.
La parodie des industries du divertissement, qu'il s'agisse de la musique pop ou du cinéma de genre, revient de façon constante dans sa filmographie. L'amitié masculine, souvent traitée sur un mode absurde et tendre à la fois, structure également plusieurs de ses films, en particulier ceux réalisés avec The Lonely Island. L'incompétence assumée de personnages persuadés de leur propre grandeur constitue par ailleurs un ressort comique récurrent de son œuvre.