Né le 16 novembre 1964, Jeff Pinkner grandit dans la banlieue de Baltimore avant d'étudier à l'université Northwestern puis à la faculté de droit de Harvard. Il débute sa carrière de scénariste avec un épisode en freelance de The Practice, avant de travailler sur les séries Profiler, Demain à la une et The Street. Il rejoint ensuite l'équipe de scénaristes d'Alias, série créée par J.J. Abrams, sur laquelle il travaille cinq années durant et dont il devient le showrunner lors des deux dernières saisons. Il enchaîne avec Lost, où il officie comme producteur exécutif en 2006 et 2007, avant de participer dès 2008 au développement de Fringe, série de science-fiction du réseau Fox dont il assure la direction créative aux côtés de J. H. Wyman jusqu'à la quatrième saison. Il se tourne ensuite davantage vers le cinéma, coécrivant The Amazing Spider-Man : Le Destin d'un héros en 2014, La Cinquième Vague en 2016 et La Tour sombre en 2017, avant de cosigner Venom ainsi que les deux films Jumanji portés par Dwayne Johnson. En 2015, il cocrée par ailleurs la série Zoo pour CBS avec André Nemec, Josh Appelbaum et Scott Rosenberg, réunis au sein de leur société commune Midnight Radio.
Sa collaboration précoce et durable avec J.J. Abrams, d'abord sur Alias puis sur Lost, a façonné en profondeur l'approche narrative de Jeff Pinkner, marquée par un goût pour les intrigues à tiroirs et les mythologies complexes déployées sur le long terme. Son passage par des études de droit à Harvard, atypique pour un scénariste de télévision, témoigne d'une rigueur analytique qu'il applique à la construction de récits feuilletonnants exigeants, à l'image de Fringe.
En tant que scénariste et showrunner plutôt que réalisateur, Jeff Pinkner privilégie des récits de science-fiction et d'espionnage à forte mythologie, où les enjeux personnels des personnages s'entrelacent avec des conspirations à grande échelle. Son travail sur Fringe a permis à la série, initialement perçue comme un hybride générique risqué, de devenir un classique culte salué pour l'audace de sa narration. Sur ses films d'action plus récents, il conserve ce goût pour les univers riches et les personnages traversés par des enjeux personnels forts, dans la lignée de son travail télévisuel.
Fringe, dont Jeff Pinkner assure la direction créative durant ses quatre premières saisons, reçoit plusieurs nominations aux Saturn Awards saluant l'inventivité de sa narration de science-fiction. Lost, sur laquelle il travaille comme producteur exécutif, remporte pour sa part l'Emmy Award de la meilleure série dramatique ainsi que le Golden Globe de la meilleure série dramatique durant la période où il y collabore.
Jeff Pinkner entretient une collaboration créative durable avec J.J. Abrams, qui l'engage successivement sur Alias et Lost avant qu'il ne poursuive sa carrière de façon plus indépendante. Il codirige par ailleurs, avec André Nemec, Josh Appelbaum et Scott Rosenberg, la société de production Midnight Radio, à travers laquelle il développe de nombreux projets communs pour le cinéma et la télévision.
Les mythologies complexes et les conspirations à grande échelle, mêlant enjeux personnels et menaces globales, constituent le fil conducteur le plus constant du travail de Jeff Pinkner, de Lost à Fringe. L'exploration de la science-fiction comme vecteur d'interrogations existentielles, plutôt que comme simple prétexte au spectacle, occupe également une place centrale dans son écriture pour la télévision, avant de se retrouver de façon plus diluée dans ses scénarios de blockbusters cinématographiques.