Léon, un tueur à gages solitaire et méthodique, vit à New York. Il trouve une enfant, Mathilda, dont la famille a été assassinée par des policiers véreux. Il accepte de la protéger, et elle devient son apprentie, apprenant les techniques du métier. Mais une relation complexe se noue entre eux, faite de confiance et de vulnérabilité. Le film est un thriller émouvant, qui mêle action et drame psychologique.