Le film alterne deux récits. En 1958, Michael Corleone règne sur l'empire familial mais doit faire face à la trahison, à la solitude et à la justice. Parallèlement, on suit l'ascension du jeune Vito Corleone, qui débarque à New York en 1901 et bâtit son empire criminel pour protéger sa famille. Deux destins, père et fils, qui montrent comment le pouvoir corrompt et détruit les liens du sang. Considéré comme l'une des plus grandes suites de l'histoire.