Au début du XXe siècle, la chercheuse intrépide Lily Houghton quitte Londres pour s'enfoncer au cœur de la jungle amazonienne à la recherche d'un arbre mythique doté de pouvoirs de guérison extraordinaires. Pour la guider sur le fleuve, elle engage Frank Wolff, un capitaine de bateau roublard et cynique qui transporte les touristes sur son embarcation délabrée. Accompagnés du frère snob de Lily, ils se lancent dans une expédition de tous les dangers à travers une nature sauvage et hostile. Ils devront affronter des forces surnaturelles ainsi qu'une expédition allemande rivale bien décidée à s'emparer du secret.