Inspiré de faits réels, Enquête sur un scandale d''État nous plonge dans les coulisses sombres de la lutte contre le trafic de stupéfiants en France. Un ancien infiltré des stups, Hubert Antoine, contacte un jeune journaliste de Libération, Stéphane Vilner, pour dénoncer les méthodes de la police. Selon lui, le haut gradé Jacques Billard dirigerait en réalité un trafic d''État au vu et au su de la République sous couvert d''opérations secrètes. Le journaliste se lance alors dans une enquête vertigineuse qui va bousculer les plus hautes sphères du pouvoir politique.