Dans un monde préhistorique, un œuf de dinosaure est volé par des ptérodactyles et se retrouve sur une île lointaine. Alors que les dinosaures se dirigent vers un lieu sûr, l'œuf éclot et Aladar, un jeune iguanodon, grandit seul. Des années plus tard, une pluie de météorites dévaste la région, forçant Aladar et ses amis à entreprendre un périlleux voyage vers la Terre des Nids, un sanctuaire légendaire.