Au Mexique, le jeune Miguel rêve de devenir un musicien accompli comme son idole Ernesto de la Cruz, malgré l'interdiction stricte de la musique imposée par sa famille depuis des générations. Bien décidé à prouver son talent lors du Jour des Morts, il se retrouve propulsé par magie dans le flamboyant et coloré Monde des Ancêtres à la suite d'un étrange quiproquo. Il y fait la rencontre d'Héctor, un squelette farceur et un peu roublard qui accepte de l'aider à retrouver son arrière-arrière-grand-père pour obtenir sa bénédiction. Ensemble, ils vont accomplir un voyage extraordinaire afin de lever le voile sur le mystère des origines de Miguel.