Après cinquante-sept ans de dérive dans l'espace, Ripley est secourue et apprend que la planète où elle a rencontré l'alien a été colonisée. Contact coupé avec les colons, les marines spatiaux l'accompagnent en mission de sauvetage, pensant affronter une simple menace. Sur place, ils découvrent des centaines d'aliens et des colonnes d'œufs gigantesques qui ont décimé la base humaine. Ripley devra surmonter ses terreurs pour protéger la petite survivante Newt et affronter une Reine des aliens démesurée.