Deux siècles après sa mort, Ripley est clonée à partir de cellules prélevées sur son cadavre afin d'extraire la Reine Alien qu'elle portait en elle. Le clone, numéro 8, possède des capacités physiques surhumaines et des souvenirs fragmentés de sa vie précédente. Lorsque des mercenaires débarquent sur le vaisseau militaire avec des captifs pour nourrir les aliens, une épidémie se déclenche. Ripley va devoir s'allier avec une androïde terroriste pour empêcher les monstres d'atteindre la Terre.