Né à Istanbul de parents turc et américain, Emre Şahin étudie la télévision et le cinéma à l'Emerson College de Boston avant de s'installer à Los Angeles, où il débute comme réalisateur et monteur de programmes de téléréalité et de documentaires pour des chaînes comme ABC, ABC Family, MTV et VH1. Son court métrage Canta, sélectionné dans plus de trente festivals internationaux, remporte le prix de la meilleure photographie au Beverly Hills Film Festival et est désigné meilleur film de l'année 2005 par le magazine Turkuaz. En 2008, il cofonde avec Sarah Wetherbee et Kelly McPherson la société de production Karga Seven Pictures, à travers laquelle il développe de nombreuses séries documentaires pour History, Discovery, National Geographic et Science Channel. Il écrit, réalise et monte en 2011 son premier long métrage de fiction, 40, tourné à Istanbul et présenté en première mondiale au Festival de Toronto, où il reçoit une mention spéciale du jury New Voices/New Visions à Palm Springs. Il crée ensuite la série événement Rise of Empires: Ottoman pour Netflix, consacrée à la conquête de Constantinople par Mehmed II, puis Midnight at the Pera Palace, série turque de voyage dans le temps centrée sur l'hôtel Pera Palace d'Istanbul.
Son enfance à Istanbul et son identité biculturelle turco-américaine nourrissent l'ensemble de son travail, qu'il s'agisse de son premier long métrage 40 ou de ses séries historiques consacrées à l'Empire ottoman. Sa formation initiale dans le documentaire et la téléréalité américaine lui a permis de développer un sens aigu du rythme narratif, qu'il applique ensuite à des productions scénarisées plus ambitieuses mêlant fiction historique et fantastique.
Şahin privilégie un cinéma de genre accessible, mêlant reconstitution historique soignée et éléments de fantastique populaire, comme en témoigne le glissement temporel qui structure Midnight at the Pera Palace. Sa double casquette de créateur et de réalisateur lui permet de conserver un contrôle narratif étroit sur des productions à grande échelle, cherchant à raconter l'histoire turque à travers un prisme accessible à un public international.
40 reçoit la mention spéciale du jury New Voices/New Visions au Festival international du film de Palm Springs, saluant son énergie et sa mise en scène stylisée. Canta cumule plusieurs prix dans les festivals internationaux, dont le prix de la meilleure photographie au Beverly Hills Film Festival et celui du meilleur court métrage étranger au Festival international du film de Fort Lauderdale.
Kelly McPherson et Sarah Wetherbee, cofondatrices avec lui de Karga Seven Pictures, demeurent ses partenaires de production les plus constants depuis 2008. Il collabore également de façon répétée avec la scénariste Kelly McPherson et le producteur Sam Anzel sur ses projets scénarisés les plus récents, dont Rise of Empires: Ottoman et Midnight at the Pera Palace.
L'histoire turque et ottomane, revisitée pour un public international à travers des formats hybrides mêlant documentaire, fiction et fantastique, occupe une place centrale dans le travail le plus récent d'Emre Şahin. La jeunesse istanbuléenne contemporaine, confrontée aux tensions sociales et économiques de la Turquie actuelle, traverse également ses projets de fiction les plus personnels, de 40 à The Team.