Deux ans se sont écoulés depuis que Sam Witwicky a sauvé l'univers d'une terrible guerre entre les robots extraterrestres. Alors qu'il s'apprête à entrer à l'université pour mener une vie normale, des visions mystiques s'emparent de son esprit. Les Decepticons reviennent plus puissants que jamais pour capturer le jeune homme et réveiller une ancienne machine de destruction. Sam, accompagné d'Optimus Prime, doit à nouveau faire face à son destin.